تعتبر كلية العلاج الطبيعى الأولي من نوعها فى مصر والبلاد العربية وقد انشئت خصيصا لمواجهة الاحتياج للاخصائيين فى العلاج الطبيعى وكانت دراسة العلاج الطبيعى قد بدات فى مصر عام 1945 تحت اشراف منظمة الصحة العالمية  لخريجى وخريجات معاهد التربية الرياضية من قبيل مسايرة التقدم العلمى فى استخدام كل ماهو مستحدث فى وسائل العلاج وبدا اعداد الكوادر اللازمة لهذا التخصص عام 1956 بايفاد البعثات الخارجية لامريكا وبريطانيا والمانيا
وفى عام 1958 بدا تطبيق نظام البعثات الداخلية لخريجى وخريجات معاهد التربية الرياضية العالية لدراسة مكثفة لمدة سنتين ثم اتجه التفكير بعد ذلك الى انشاء المعهد العالى للعلاج الطبيعى على ان يلحق – مؤقتا كشعبة بالمعهد العالى للتربية الرياضية وهو ماتم بالفعل عام 1962.
وفى عام 1969 اصبح المعهد مستقلا ثم انضم الى الجامعة عام 1976 بعد ان كانت تشرف عليه وزارة التعليم العالى واصبحت الدراسة فيه خمس سنوات حيث تقرر اضافة سنة تدريبية لزيادة كفاءة الخريجين واكتسابهم مهارات الاداء , وفى عام 1992 صدر قرار بتحويل المعهد إلى كلية العلاج الطبيعي - جامعة القاهرة.